home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Shareware Overload Trio 2 / Shareware Overload Trio Volume 2 (Chestnut CD-ROM).ISO / dir26 / med9408a.zip / M9480100.TXT < prev    next >
Text File  |  1994-08-09  |  3KB  |  48 lines
  1.        Document 0100
  2.  DOCN  M9480100
  3.  TI    Identification of low-level contamination of blood as basis for
  4.        detection of human immunodeficiency virus (HIV) DNA in anti-HIV-negative
  5.        specimens.
  6.  DT    9410
  7.  AU    Sabino EC; Delwart E; Lee TH; Mayer A; Mullins JI; Busch MP; Irwin
  8.        Memorial Blood Centers, San Francisco, CA 94118.
  9.  SO    J Acquir Immune Defic Syndr. 1994 Aug;7(8):853-9. Unique Identifier :
  10.        AIDSLINE GENBANK/L20380
  11.  AB    The significance of detection of human immunodeficiency virus (HIV) DNA
  12.        by the polymerase chain reaction (PCR) in seronegative or seroconverting
  13.        (SC) subjects remains controversial. In a previously reported study, we
  14.        identified a case in which a specimen collected 12 months before
  15.        seroconversion (pre-SC) was found repeatedly to be PCR positive in three
  16.        experienced laboratories, while the 6-month pre-SC bleed was
  17.        PCR-negative; PCR-based human leukocyte antigen (HLA)-DQA and -DRB
  18.        typing of serial peripheral blood mononuclear cell (PBMC) samples from
  19.        this case did not indicate a specimen mix-up or labeling error. To
  20.        further investigate this case, we used HIV env sequence and DNA
  21.        heteroduplex gel-shift analyses to characterize HIV quasispecies present
  22.        in serial pre- and post-SC specimens. HIV env sequences and gel-shift
  23.        pattern analyses from the 12-month pre-SC versus post-SC samples
  24.        indicated that markedly distinct quasispecies were present, suggesting
  25.        possible abortive infection followed by reinfection and subsequent
  26.        seroconversion. However, the HIV burden of this pre-SC sample was very
  27.        low (1 provirus/10(6) PBMCs), and the quasispecies was highly
  28.        heterogeneous, findings suggesting long-term rather than recent HIV
  29.        infection. To test the hypothesis that the index pre-SC sample was PCR
  30.        positive owing to trace blood contamination during initial processing,
  31.        we analyzed the three seropositive samples collected on the same date in
  32.        1985. One of these samples was highly related to the index pre-SC sample
  33.        by env sequence and gel-shift methodologies.(ABSTRACT TRUNCATED AT 250
  34.        WORDS)
  35.  DE    Base Sequence  Blotting, Western  Cell Separation  Consensus Sequence
  36.        Diagnostic Errors  DNA Primers/CHEMISTRY  DNA, Viral/*BLOOD/CHEMISTRY
  37.        Gene Products, env/GENETICS/IMMUNOLOGY  Human  HIV Antibodies/*BLOOD
  38.        HIV Envelope Protein gp120/GENETICS  *HIV Seronegativity  HIV
  39.        Seropositivity/*DIAGNOSIS  HIV-1/*GENETICS/IMMUNOLOGY/ISOLATION & PURIF
  40.        HLA-DR2 Antigen/GENETICS  Leukocytes, Mononuclear/MICROBIOLOGY
  41.        Molecular Sequence Data  Peptide Fragments/GENETICS  Polymerase Chain
  42.        Reaction  Protein Precursors/IMMUNOLOGY  Sequence Homology, Nucleic Acid
  43.        Support, U.S. Gov't, P.H.S.  JOURNAL ARTICLE
  44.  
  45.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  46.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  47.  
  48.